Несколько недель назад Томас попал в Глэйд – квадратный участок земли, поросший лесом и окруженный гигантским Лабиринтом. Это место населяли подростки, ничего не помнящие о прошлой жизни. Назвав себя глейдерами, они стали обживать новый дом. После появления единственной среди юношей девушки все изменилось. Лабиринт не закрылся на ночь, и населяющие его механические гриверы начали охоту на жителей Глэйда. Томас предложил рискнуть и прорваться в сердце исполинской постройки, в надежде, что это и есть путь к спасению. Ценой жизни нескольких друзей группе глейдеров удалось этой сделать. В центре лабиринта они находят лабораторию с телами погибших ученых и послание, адресованное им. Оказывается, население Земли поразил страшный вирус, а сама планета пострадала от резко усилившейся солнечной активности. Подростки – это последняя надежда человечества на получение вакцины. Но для этого они должны пройти несколько жестоких тестов на выживание, и Лабиринт – только первый из них. Теперь организация ПОРОК, разрабатывающая вакцину, отправляет глейдеров наружу, в раскаленную пустыню, населенную зараженными людьми. Подростки узнают, что их группа была не единственной, и что ПОРОК специально заразил всех глейдеров вирусом. Им нужно за две недели добраться до контрольной точки на севере, где находится лекарство.